Вообще то подключаемые библиотеки при компилляции попадают в сам скрипт, т.ч можно смело компилировать и запускать, exe'шнику уже ничего не нужно будет. Это конечно зависит от используемых им ресурсов (файлы иконок, шрифты, и т.п.).
Даже большее скажу, сам скомпилированный скрипт имеет встроены интерпритатор, точно тот же что и в установленном AutoIt, поэтому “голые” скрипты можно запускать даже на машине без установленного AutoIt - используя интерпритатор скомпилированного скрипта (в справке об этом подробнее написано).